Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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SEC23BQ15437 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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SEC23BQ15437 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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SEC23BQ15437 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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SEC23BQ15437 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC23BQ15437 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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SEC23BQ15437 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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SEC23BQ15437 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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SEC23BQ15437 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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SEC23BQ15437 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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SEC23BQ15437 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC23BQ15437 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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