Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP1Q15431 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP1Q15431 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
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