Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK1Q15118 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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