Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC3Q15034 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms