Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 NRBP1-205ENST00000419281 674 ntTSL 312.57□□□□□ -0.41e-12■■■■■ 54.5
EFTUD2Q15029 LMF2-205ENST00000507607 605 ntTSL 217.56■□□□□ 0.44e-11■■■■■ 54.5
EFTUD2Q15029 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 54.4
EFTUD2Q15029 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.792e-8■■■■■ 54.4
EFTUD2Q15029 RUVBL2-208ENST00000596247 1563 ntTSL 219.16■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 54.4
EFTUD2Q15029 RUVBL2-201ENST00000221413 1478 ntTSL 1 (best)16.48■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 54.4
EFTUD2Q15029 ATXN7L3-211ENST00000591807 542 ntTSL 413.86□□□□□ -0.195e-13■■■■■ 54.4
EFTUD2Q15029 ID3-203ENST00000486541 892 ntTSL 1 (best)17.4■□□□□ 0.388e-7■■■■■ 54.3
EFTUD2Q15029 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.068e-7■■■■■ 54.3
EFTUD2Q15029 SLC25A15-204ENST00000478827 1142 ntTSL 523.06■■□□□ 1.281e-9■■■■■ 54.3
EFTUD2Q15029 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.121e-9■■■■■ 54.3
EFTUD2Q15029 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-9■■■■■ 54.3
EFTUD2Q15029 GNA11-203ENST00000586763 354 ntTSL 314.91□□□□□ -0.021e-9■■■■■ 54.3
EFTUD2Q15029 CHD4-214ENST00000545942 1317 ntTSL 1 (best)21.21■□□□□ 0.993e-12■■■■■ 54.3
EFTUD2Q15029 CHD4-213ENST00000545584 553 ntTSL 418.57■□□□□ 0.563e-12■■■■■ 54.3
EFTUD2Q15029 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.865e-9■■■■■ 54.1
EFTUD2Q15029 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.385e-9■■■■■ 54.1
EFTUD2Q15029 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.125e-9■■■■■ 54.1
EFTUD2Q15029 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.115e-9■■■■■ 54.1
EFTUD2Q15029 RPL8-208ENST00000529163 556 ntTSL 210.91□□□□□ -0.665e-9■■■■■ 54.1
EFTUD2Q15029 P3H3-210ENST00000545596 567 ntTSL 217.49■□□□□ 0.399e-8■■■■■ 54.1
EFTUD2Q15029 P3H3-211ENST00000612048 2129 ntTSL 1 (best)17.63■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 54.1
EFTUD2Q15029 PANK4-208ENST00000502512 706 ntTSL 317.1■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 MKI67-204ENST00000478293 654 ntTSL 512.57□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.853e-8■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.43e-8■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 PPAN-207ENST00000468881 627 ntTSL 216.85■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 HPS1-205ENST00000414009 857 ntTSL 214.29□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 HPS1-214ENST00000498219 845 ntTSL 514.28□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.273e-7■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 KCNIP2-205ENST00000355657 2617 ntTSL 221.85■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 KCNIP2-209ENST00000434163 534 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 KCNIP2-204ENST00000353068 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 KCNIP2-201ENST00000239117 555 ntTSL 1 (best)8.48□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.233e-7■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 KCNIP2-212ENST00000472764 847 ntTSL 56.78□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.393e-7■■■■■ 54
EFTUD2Q15029 FASTK-206ENST00000465272 457 ntTSL 218.67■□□□□ 0.585e-10■■■■■ 53.9
EFTUD2Q15029 TOMM40L-206ENST00000474486 2396 ntTSL 215.8■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-6■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 TOMM40L-208ENST00000492482 1120 ntTSL 313.58□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 TOMM40L-205ENST00000470426 845 ntTSL 511.85□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.677e-13■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.387e-13■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.367e-13■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 RPS2-213ENST00000533161 1186 ntTSL 1 (best)21.99■■□□□ 1.117e-13■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.749e-9■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 DOLPP1-201ENST00000327812 1932 ntTSL 1 (best)18.64■□□□□ 0.589e-9■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.49e-9■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 DOLPP1-204ENST00000412363 911 ntTSL 516.58■□□□□ 0.249e-9■■■■■ 53.7
EFTUD2Q15029 GPX3-206ENST00000521632 1314 ntTSL 514.33□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 53.5
EFTUD2Q15029 PREB-204ENST00000430533 615 ntTSL 28.94□□□□□ -0.981e-12■■■■■ 53.5
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EFTUD2Q15029 FDXR-213ENST00000581219 567 ntTSL 416.06■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 53.5
EFTUD2Q15029 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 53.4
EFTUD2Q15029 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 53.4
EFTUD2Q15029 BRCC3-204ENST00000369462 2846 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 53.4
EFTUD2Q15029 BRCC3-210ENST00000630295 954 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -12e-6■■■■■ 53.4
EFTUD2Q15029 BRCC3-206ENST00000399042 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -12e-6■■■■■ 53.4
EFTUD2Q15029 BRCC3-207ENST00000411985 688 ntTSL 58.7□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 53.4
EFTUD2Q15029 BRCC3-208ENST00000453705 2694 ntTSL 58.1□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 53.4
EFTUD2Q15029 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 53.4
EFTUD2Q15029 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 53.4
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-211ENST00000504779 792 ntTSL 512.89□□□□□ -0.353e-36■■■■■ 53.4
EFTUD2Q15029 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.173e-13■■■■■ 53.3
EFTUD2Q15029 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.313e-13■■■■■ 53.3
EFTUD2Q15029 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.43e-13■■■■■ 53.3
EFTUD2Q15029 HDLBP-231ENST00000467435 639 ntTSL 212.57□□□□□ -0.41e-34■■■■■ 53.3
EFTUD2Q15029 HDLBP-226ENST00000453141 997 ntTSL 37.71□□□□□ -1.181e-34■■■■■ 53.3
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-205ENST00000534885 2069 ntTSL 1 (best)20.63■□□□□ 0.896e-7■■■■■ 53.3
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.86e-7■■■■■ 53.3
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 53.3
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-216ENST00000543995 1531 ntTSL 514.21□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 53.3
EFTUD2Q15029 CXXC1-209ENST00000587342 802 ntTSL 215.23■□□□□ 0.032e-19■■■■■ 53.3
EFTUD2Q15029 CXXC1-208ENST00000587170 476 ntTSL 213.03□□□□□ -0.322e-19■■■■■ 53.3
EFTUD2Q15029 CLASRP-211ENST00000588247 599 ntTSL 217.77■□□□□ 0.446e-23■■■■■ 53.3
EFTUD2Q15029 LLGL2-206ENST00000577211 543 ntTSL 313.97□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 MCM2-207ENST00000477668 2510 ntTSL 220.26■□□□□ 0.833e-9■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 MCM2-206ENST00000474964 2847 ntTSL 217.29■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 MCM2-209ENST00000491422 2844 ntTSL 514.4□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-9■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 C21orf58-210ENST00000491666 1196 ntTSL 513.54□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 C21orf58-206ENST00000417060 1072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 ENTPD7-201ENST00000370489 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.618e-9■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 ABCC1-204ENST00000572882 4565 ntTSL 1 (best)10.46□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 B4GALT3-210ENST00000487004 703 ntTSL 513.85□□□□□ -0.195e-9■■■■■ 53.2
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