Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RASGRF1Q13972 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RASGRF1Q13972 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RASGRF1Q13972 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RASGRF1Q13972 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RASGRF1Q13972 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RASGRF1Q13972 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms