Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCINQ13939 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCINQ13939 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCINQ13939 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCINQ13939 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCINQ13939 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCINQ13939 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCINQ13939 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCINQ13939 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCINQ13939 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCINQ13939 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCINQ13939 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCINQ13939 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCINQ13939 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCINQ13939 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCINQ13939 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCINQ13939 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCINQ13939 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCINQ13939 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCINQ13939 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCINQ13939 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCINQ13939 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCINQ13939 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCINQ13939 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCINQ13939 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCINQ13939 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCINQ13939 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCINQ13939 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCINQ13939 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCINQ13939 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCINQ13939 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCINQ13939 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCINQ13939 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCINQ13939 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCINQ13939 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCINQ13939 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCINQ13939 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCINQ13939 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCINQ13939 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCINQ13939 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCINQ13939 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCINQ13939 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCINQ13939 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCINQ13939 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCINQ13939 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCINQ13939 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCINQ13939 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCINQ13939 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCINQ13939 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCINQ13939 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCINQ13939 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCINQ13939 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCINQ13939 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCINQ13939 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCINQ13939 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCINQ13939 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCINQ13939 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCINQ13939 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCINQ13939 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCINQ13939 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCINQ13939 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCINQ13939 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCINQ13939 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCINQ13939 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCINQ13939 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCINQ13939 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCINQ13939 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCINQ13939 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCINQ13939 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCINQ13939 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCINQ13939 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCINQ13939 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCINQ13939 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCINQ13939 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCINQ13939 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCINQ13939 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCINQ13939 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCINQ13939 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCINQ13939 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCINQ13939 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCINQ13939 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCINQ13939 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCINQ13939 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCINQ13939 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCINQ13939 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCINQ13939 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCINQ13939 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCINQ13939 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCINQ13939 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCINQ13939 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCINQ13939 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCINQ13939 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCINQ13939 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCINQ13939 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCINQ13939 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCINQ13939 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCINQ13939 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCINQ13939 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCINQ13939 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCINQ13939 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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