Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX39BQ13838 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39BQ13838 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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