Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA9Q13797 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGA9Q13797 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms