Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALKBH1Q13686 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALKBH1Q13686 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALKBH1Q13686 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms