Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRQ13535 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRQ13535 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRQ13535 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRQ13535 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRQ13535 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRQ13535 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRQ13535 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRQ13535 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRQ13535 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRQ13535 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRQ13535 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRQ13535 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRQ13535 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRQ13535 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRQ13535 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRQ13535 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRQ13535 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRQ13535 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRQ13535 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRQ13535 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRQ13535 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRQ13535 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRQ13535 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRQ13535 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRQ13535 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRQ13535 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRQ13535 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRQ13535 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRQ13535 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRQ13535 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRQ13535 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRQ13535 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRQ13535 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRQ13535 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRQ13535 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRQ13535 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRQ13535 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRQ13535 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRQ13535 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRQ13535 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRQ13535 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRQ13535 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRQ13535 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRQ13535 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRQ13535 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRQ13535 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRQ13535 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRQ13535 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRQ13535 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRQ13535 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRQ13535 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRQ13535 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRQ13535 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRQ13535 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRQ13535 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRQ13535 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRQ13535 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRQ13535 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRQ13535 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRQ13535 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRQ13535 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRQ13535 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRQ13535 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRQ13535 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRQ13535 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRQ13535 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRQ13535 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRQ13535 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRQ13535 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRQ13535 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRQ13535 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRQ13535 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRQ13535 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRQ13535 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRQ13535 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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