Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUSC3Q13454 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TUSC3Q13454 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUSC3Q13454 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUSC3Q13454 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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