Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2V1Q13404 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2V1Q13404 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2V1Q13404 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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