Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRSF6Q13247 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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