Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX3Q13185 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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