Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSTF3Q12996 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTF3Q12996 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSTF3Q12996 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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