Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANK3Q12955 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANK3Q12955 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANK3Q12955 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ANK3Q12955 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANK3Q12955 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANK3Q12955 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms