Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX4Q12846 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX4Q12846 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX4Q12846 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STX4Q12846 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STX4Q12846 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STX4Q12846 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STX4Q12846 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX4Q12846 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX4Q12846 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX4Q12846 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX4Q12846 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
STX4Q12846 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX4Q12846 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX4Q12846 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX4Q12846 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STX4Q12846 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX4Q12846 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX4Q12846 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX4Q12846 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX4Q12846 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX4Q12846 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX4Q12846 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX4Q12846 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX4Q12846 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX4Q12846 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX4Q12846 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX4Q12846 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX4Q12846 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX4Q12846 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STX4Q12846 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX4Q12846 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX4Q12846 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STX4Q12846 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX4Q12846 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX4Q12846 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX4Q12846 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX4Q12846 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STX4Q12846 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX4Q12846 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX4Q12846 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX4Q12846 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX4Q12846 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX4Q12846 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX4Q12846 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX4Q12846 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX4Q12846 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX4Q12846 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX4Q12846 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX4Q12846 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STX4Q12846 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX4Q12846 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX4Q12846 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX4Q12846 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX4Q12846 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX4Q12846 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX4Q12846 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX4Q12846 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STX4Q12846 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX4Q12846 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX4Q12846 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX4Q12846 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX4Q12846 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX4Q12846 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX4Q12846 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX4Q12846 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX4Q12846 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STX4Q12846 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX4Q12846 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX4Q12846 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX4Q12846 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX4Q12846 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX4Q12846 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX4Q12846 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STX4Q12846 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX4Q12846 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX4Q12846 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX4Q12846 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX4Q12846 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX4Q12846 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX4Q12846 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX4Q12846 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX4Q12846 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX4Q12846 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX4Q12846 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX4Q12846 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX4Q12846 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX4Q12846 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX4Q12846 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX4Q12846 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX4Q12846 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX4Q12846 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX4Q12846 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX4Q12846 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX4Q12846 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX4Q12846 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX4Q12846 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX4Q12846 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX4Q12846 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
STX4Q12846 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms