Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BPTFQ12830 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BPTFQ12830 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
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