Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL1Q08397 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL1Q08397 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms