Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXM1Q08050 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXM1Q08050 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms