Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFF3Q07654 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TFF3Q07654 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms