Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4BQ07343 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE4BQ07343 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4BQ07343 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4BQ07343 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4BQ07343 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4BQ07343 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4BQ07343 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4BQ07343 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4BQ07343 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4BQ07343 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4BQ07343 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4BQ07343 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4BQ07343 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms