Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD164Q04900 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CD164Q04900 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CD164Q04900 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CD164Q04900 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CD164Q04900 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CD164Q04900 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CD164Q04900 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CD164Q04900 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CD164Q04900 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CD164Q04900 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CD164Q04900 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CD164Q04900 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CD164Q04900 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CD164Q04900 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CD164Q04900 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CD164Q04900 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CD164Q04900 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CD164Q04900 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CD164Q04900 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CD164Q04900 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CD164Q04900 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD164Q04900 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD164Q04900 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD164Q04900 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms