Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT17Q04695 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT17Q04695 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms