Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNB2Q03252 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms