Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPCQ03188 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPCQ03188 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPCQ03188 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms