Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHLH1Q02575 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHLH1Q02575 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms