Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1DQ01668 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms