Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1BQ00975 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms