Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTHL1P78549 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NTHL1P78549 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTHL1P78549 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms