Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOMO3P69849 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOMO3P69849 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NOMO3P69849 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms