Protein–RNA interactions for Protein: P63124

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P63124 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERV-K104P63124 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERV-K104P63124 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms