Protein–RNA interactions for Protein: P62633

CNBP, Cellular nucleic acid-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBPP62633 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBPP62633 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBPP62633 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBPP62633 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBPP62633 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBPP62633 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBPP62633 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBPP62633 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBPP62633 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBPP62633 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBPP62633 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBPP62633 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBPP62633 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBPP62633 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBPP62633 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBPP62633 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBPP62633 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNBPP62633 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBPP62633 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBPP62633 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBPP62633 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBPP62633 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBPP62633 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBPP62633 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBPP62633 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBPP62633 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBPP62633 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBPP62633 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBPP62633 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBPP62633 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBPP62633 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBPP62633 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBPP62633 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBPP62633 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBPP62633 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBPP62633 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBPP62633 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBPP62633 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBPP62633 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBPP62633 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBPP62633 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBPP62633 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBPP62633 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBPP62633 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBPP62633 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBPP62633 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBPP62633 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBPP62633 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBPP62633 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBPP62633 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBPP62633 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBPP62633 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBPP62633 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBPP62633 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNBPP62633 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBPP62633 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBPP62633 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms