Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPAN5P62079 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPAN5P62079 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPAN5P62079 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPAN5P62079 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPAN5P62079 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSPAN5P62079 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSPAN5P62079 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSPAN5P62079 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSPAN5P62079 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPAN5P62079 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPAN5P62079 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms