Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS3AP61247 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS3AP61247 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms