Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3S2P59780 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms