Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFERP55789 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFERP55789 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFERP55789 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFERP55789 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFERP55789 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFERP55789 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFERP55789 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFERP55789 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFERP55789 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFERP55789 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFERP55789 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFERP55789 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFERP55789 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFERP55789 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GFERP55789 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GFERP55789 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFERP55789 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFERP55789 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GFERP55789 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFERP55789 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GFERP55789 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFERP55789 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GFERP55789 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GFERP55789 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFERP55789 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFERP55789 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFERP55789 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFERP55789 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFERP55789 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GFERP55789 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFERP55789 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFERP55789 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFERP55789 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFERP55789 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFERP55789 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFERP55789 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFERP55789 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFERP55789 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFERP55789 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFERP55789 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFERP55789 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFERP55789 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GFERP55789 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFERP55789 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFERP55789 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFERP55789 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GFERP55789 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFERP55789 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFERP55789 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFERP55789 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GFERP55789 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFERP55789 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFERP55789 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFERP55789 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFERP55789 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFERP55789 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFERP55789 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFERP55789 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFERP55789 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFERP55789 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFERP55789 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GFERP55789 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFERP55789 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFERP55789 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFERP55789 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFERP55789 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFERP55789 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFERP55789 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFERP55789 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFERP55789 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFERP55789 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFERP55789 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFERP55789 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GFERP55789 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFERP55789 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFERP55789 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GFERP55789 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFERP55789 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFERP55789 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFERP55789 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GFERP55789 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GFERP55789 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFERP55789 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFERP55789 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GFERP55789 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFERP55789 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFERP55789 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFERP55789 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFERP55789 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFERP55789 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFERP55789 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFERP55789 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFERP55789 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFERP55789 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFERP55789 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFERP55789 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFERP55789 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFERP55789 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFERP55789 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms