Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA4P54764 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms