Protein–RNA interactions for Protein: P53040

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, yeastyeast

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF6P53040 YPL277CYPL277C 1464 nt6□□□□□ -1.45
TAF6P53040 HIS7YBR248C 1659 nt6□□□□□ -1.45
TAF6P53040 YEH1YLL012W 1722 nt5.99□□□□□ -1.45
TAF6P53040 PSR2YLR019W 1194 nt5.99□□□□□ -1.45
TAF6P53040 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.99□□□□□ -1.45
TAF6P53040 SCS7YMR272C 1155 nt5.99□□□□□ -1.45
TAF6P53040 SCS22YBL091C-A 528 nt5.99□□□□□ -1.45
TAF6P53040 JIP4YDR475C 2631 nt5.99□□□□□ -1.45
TAF6P53040 PMP3YDR276C 168 nt5.98□□□□□ -1.45
TAF6P53040 PFA3YNL326C 1011 nt5.98□□□□□ -1.45
TAF6P53040 DIA3YDL024C 1407 nt5.98□□□□□ -1.45
TAF6P53040 YDL057WYDL057W 987 nt5.97□□□□□ -1.45
TAF6P53040 OPI7YDR360W 435 nt5.97□□□□□ -1.45
TAF6P53040 COG1YGL223C 1254 nt5.97□□□□□ -1.45
TAF6P53040 CDC16YKL022C 2523 nt5.97□□□□□ -1.45
TAF6P53040 MCM6YGL201C 3054 nt5.97□□□□□ -1.45
TAF6P53040 IDP1YDL066W 1287 nt5.96□□□□□ -1.46
TAF6P53040 HSP150YJL159W 1242 nt5.96□□□□□ -1.46
TAF6P53040 YNL017CYNL017C 339 nt5.96□□□□□ -1.46
TAF6P53040 ALT2YDR111C 1524 nt5.95□□□□□ -1.46
TAF6P53040 HXT17YNR072W 1695 nt5.95□□□□□ -1.46
TAF6P53040 PHB1YGR132C 864 nt5.95□□□□□ -1.46
TAF6P53040 CAF40YNL288W 1122 nt5.95□□□□□ -1.46
TAF6P53040 SCO2YBR024W 906 nt5.95□□□□□ -1.46
TAF6P53040 YPL136WYPL136W 369 nt5.95□□□□□ -1.46
TAF6P53040 SNU71YGR013W 1863 nt5.94□□□□□ -1.46
TAF6P53040 LSG1YGL099W 1923 nt5.94□□□□□ -1.46
TAF6P53040 TSR3YOR006C 942 nt5.94□□□□□ -1.46
TAF6P53040 RAD24YER173W 1980 nt5.94□□□□□ -1.46
TAF6P53040 ICL1YER065C 1674 nt5.94□□□□□ -1.46
TAF6P53040 SAC6YDR129C 1929 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF6P53040 QNS1YHR074W 2145 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF6P53040 GIT1YCR098C 1557 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF6P53040 TNA1YGR260W 1605 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF6P53040 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF6P53040 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF6P53040 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF6P53040 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF6P53040 RMA1YKL132C 1293 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF6P53040 YMR252CYMR252C 405 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF6P53040 YBL112CYBL112C 318 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF6P53040 TBF1YPL128C 1689 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF6P53040 MID1YNL291C 1647 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF6P53040 ERG1YGR175C 1491 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF6P53040 OSW2YLR054C 2175 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF6P53040 YDL218WYDL218W 954 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF6P53040 KSS1YGR040W 1107 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF6P53040 DJP1YIR004W 1299 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF6P53040 MDH1YKL085W 1005 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF6P53040 YMR122CYMR122C 375 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF6P53040 HSF1YGL073W 2502 nt5.91□□□□□ -1.46
TAF6P53040 EPS1YIL005W 2106 nt5.91□□□□□ -1.46
TAF6P53040 STM1YLR150W 822 nt5.91□□□□□ -1.46
TAF6P53040 SFB3YHR098C 2790 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF6P53040 CDC1YDR182W 1476 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF6P53040 ENT2YLR206W 1842 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF6P53040 GDA1YEL042W 1557 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF6P53040 SKN1YGR143W 2316 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF6P53040 YDR015CYDR015C 240 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF6P53040 SIP2YGL208W 1248 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF6P53040 YLR317WYLR317W 435 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF6P53040 QDR3YBR043C 2070 nt5.9□□□□□ -1.47
TAF6P53040 MKK2YPL140C 1521 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF6P53040 TFG2YGR005C 1203 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF6P53040 NPA3YJR072C 1158 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF6P53040 KDX1YKL161C 1302 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF6P53040 TRP3YKL211C 1455 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF6P53040 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF6P53040 HVG1YER039C 750 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF6P53040 LYS12YIL094C 1116 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF6P53040 TDH2YJR009C 999 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF6P53040 DRE2YKR071C 1047 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF6P53040 JNM1YMR294W 1122 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF6P53040 YTH1YPR107C 627 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF6P53040 GPA2YER020W 1350 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF6P53040 YFL052WYFL052W 1398 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF6P53040 SPS22YCL048W 1392 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF6P53040 UTP4YDR324C 2331 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF6P53040 BUD9YGR041W 1644 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF6P53040 GAA1YLR088W 1845 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF6P53040 MSP1YGR028W 1089 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF6P53040 YKL223WYKL223W 333 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF6P53040 POR1YNL055C 852 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF6P53040 YNL285WYNL285W 372 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF6P53040 CHS5YLR330W 2016 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF6P53040 YDR109CYDR109C 2148 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF6P53040 VPS70YJR126C 2436 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF6P53040 GYP1YOR070C 1914 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF6P53040 APE3YBR286W 1614 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF6P53040 CMR1YDL156W 1569 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF6P53040 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF6P53040 GFD1YMR255W 567 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF6P53040 YMR295CYMR295C 594 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF6P53040 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF6P53040 VNX1YNL321W 2727 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF6P53040 SMF2YHR050W 1650 nt5.85□□□□□ -1.47
TAF6P53040 YLR184WYLR184W 348 nt5.85□□□□□ -1.47
TAF6P53040 GSY2YLR258W 2118 nt5.85□□□□□ -1.47
TAF6P53040 RIM101YHL027W 1878 nt5.84□□□□□ -1.47
TAF6P53040 GAL83YER027C 1254 nt5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.2 ms