Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC25A1P53007 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A1P53007 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC25A1P53007 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A1P53007 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A1P53007 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A1P53007 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A1P53007 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A1P53007 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A1P53007 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms