Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DAP3P51398 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DAP3P51398 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DAP3P51398 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DAP3P51398 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DAP3P51398 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DAP3P51398 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DAP3P51398 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DAP3P51398 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DAP3P51398 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DAP3P51398 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DAP3P51398 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DAP3P51398 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DAP3P51398 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DAP3P51398 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DAP3P51398 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DAP3P51398 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DAP3P51398 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DAP3P51398 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DAP3P51398 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DAP3P51398 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DAP3P51398 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DAP3P51398 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DAP3P51398 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DAP3P51398 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DAP3P51398 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DAP3P51398 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DAP3P51398 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DAP3P51398 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DAP3P51398 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DAP3P51398 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DAP3P51398 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DAP3P51398 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DAP3P51398 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DAP3P51398 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DAP3P51398 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DAP3P51398 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DAP3P51398 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DAP3P51398 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DAP3P51398 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DAP3P51398 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DAP3P51398 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DAP3P51398 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DAP3P51398 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DAP3P51398 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DAP3P51398 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DAP3P51398 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DAP3P51398 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DAP3P51398 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DAP3P51398 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DAP3P51398 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DAP3P51398 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DAP3P51398 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DAP3P51398 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DAP3P51398 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DAP3P51398 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DAP3P51398 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DAP3P51398 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DAP3P51398 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DAP3P51398 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DAP3P51398 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DAP3P51398 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DAP3P51398 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DAP3P51398 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DAP3P51398 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DAP3P51398 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DAP3P51398 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DAP3P51398 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DAP3P51398 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DAP3P51398 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DAP3P51398 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DAP3P51398 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DAP3P51398 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DAP3P51398 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DAP3P51398 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DAP3P51398 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DAP3P51398 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DAP3P51398 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DAP3P51398 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DAP3P51398 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DAP3P51398 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DAP3P51398 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DAP3P51398 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DAP3P51398 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DAP3P51398 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DAP3P51398 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DAP3P51398 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms