Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1BP51168 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNN1BP51168 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNN1BP51168 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNN1BP51168 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNN1BP51168 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNN1BP51168 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNN1BP51168 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1BP51168 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1BP51168 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1BP51168 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms