Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF10P50591 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms