Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB561P49447 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB561P49447 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB561P49447 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB561P49447 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB561P49447 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB561P49447 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB561P49447 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB561P49447 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYB561P49447 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYB561P49447 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYB561P49447 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYB561P49447 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB561P49447 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB561P49447 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB561P49447 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB561P49447 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB561P49447 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB561P49447 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB561P49447 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB561P49447 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB561P49447 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYB561P49447 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYB561P49447 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYB561P49447 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYB561P49447 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYB561P49447 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYB561P49447 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYB561P49447 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYB561P49447 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYB561P49447 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYB561P49447 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYB561P49447 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYB561P49447 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYB561P49447 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYB561P49447 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYB561P49447 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYB561P49447 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYB561P49447 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYB561P49447 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYB561P49447 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYB561P49447 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYB561P49447 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYB561P49447 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYB561P49447 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYB561P49447 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYB561P49447 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYB561P49447 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYB561P49447 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYB561P49447 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYB561P49447 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYB561P49447 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYB561P49447 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYB561P49447 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYB561P49447 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYB561P49447 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYB561P49447 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYB561P49447 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYB561P49447 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYB561P49447 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYB561P49447 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYB561P49447 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYB561P49447 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYB561P49447 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYB561P49447 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYB561P49447 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYB561P49447 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYB561P49447 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYB561P49447 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYB561P49447 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYB561P49447 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYB561P49447 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYB561P49447 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB561P49447 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB561P49447 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB561P49447 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB561P49447 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB561P49447 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB561P49447 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB561P49447 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB561P49447 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYB561P49447 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYB561P49447 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYB561P49447 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYB561P49447 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYB561P49447 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYB561P49447 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYB561P49447 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYB561P49447 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYB561P49447 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYB561P49447 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CYB561P49447 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYB561P49447 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYB561P49447 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYB561P49447 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CYB561P49447 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYB561P49447 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYB561P49447 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYB561P49447 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYB561P49447 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms