Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN1BP46527 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKN1BP46527 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms