Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAGEA1P43355 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEA1P43355 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms