Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGIRP43119 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGIRP43119 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms