Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBL1P41271 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBL1P41271 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBL1P41271 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBL1P41271 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBL1P41271 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBL1P41271 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBL1P41271 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBL1P41271 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBL1P41271 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBL1P41271 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBL1P41271 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBL1P41271 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBL1P41271 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NBL1P41271 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBL1P41271 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBL1P41271 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBL1P41271 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBL1P41271 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBL1P41271 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NBL1P41271 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBL1P41271 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBL1P41271 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBL1P41271 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBL1P41271 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBL1P41271 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBL1P41271 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBL1P41271 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBL1P41271 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NBL1P41271 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBL1P41271 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBL1P41271 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NBL1P41271 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NBL1P41271 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NBL1P41271 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBL1P41271 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBL1P41271 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBL1P41271 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBL1P41271 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBL1P41271 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NBL1P41271 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBL1P41271 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBL1P41271 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NBL1P41271 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NBL1P41271 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NBL1P41271 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBL1P41271 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBL1P41271 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NBL1P41271 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBL1P41271 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBL1P41271 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBL1P41271 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBL1P41271 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBL1P41271 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBL1P41271 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBL1P41271 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBL1P41271 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBL1P41271 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBL1P41271 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBL1P41271 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBL1P41271 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBL1P41271 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBL1P41271 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NBL1P41271 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBL1P41271 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBL1P41271 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBL1P41271 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBL1P41271 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBL1P41271 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBL1P41271 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBL1P41271 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBL1P41271 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBL1P41271 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBL1P41271 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBL1P41271 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBL1P41271 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBL1P41271 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NBL1P41271 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBL1P41271 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBL1P41271 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBL1P41271 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBL1P41271 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBL1P41271 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBL1P41271 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBL1P41271 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBL1P41271 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBL1P41271 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBL1P41271 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBL1P41271 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBL1P41271 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBL1P41271 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBL1P41271 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBL1P41271 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBL1P41271 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBL1P41271 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NBL1P41271 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NBL1P41271 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NBL1P41271 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NBL1P41271 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NBL1P41271 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms