Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MLH1P40692 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MLH1P40692 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MLH1P40692 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MLH1P40692 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MLH1P40692 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MLH1P40692 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MLH1P40692 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MLH1P40692 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLH1P40692 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLH1P40692 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLH1P40692 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLH1P40692 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLH1P40692 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLH1P40692 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLH1P40692 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLH1P40692 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLH1P40692 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLH1P40692 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLH1P40692 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MLH1P40692 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MLH1P40692 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MLH1P40692 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MLH1P40692 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MLH1P40692 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MLH1P40692 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MLH1P40692 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MLH1P40692 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MLH1P40692 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MLH1P40692 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MLH1P40692 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH1P40692 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH1P40692 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH1P40692 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH1P40692 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH1P40692 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH1P40692 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH1P40692 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH1P40692 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH1P40692 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH1P40692 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH1P40692 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH1P40692 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH1P40692 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH1P40692 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH1P40692 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH1P40692 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH1P40692 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH1P40692 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH1P40692 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH1P40692 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH1P40692 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH1P40692 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH1P40692 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH1P40692 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH1P40692 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH1P40692 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH1P40692 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH1P40692 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH1P40692 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH1P40692 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH1P40692 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH1P40692 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH1P40692 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH1P40692 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH1P40692 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH1P40692 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH1P40692 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH1P40692 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH1P40692 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH1P40692 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH1P40692 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH1P40692 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH1P40692 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH1P40692 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH1P40692 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH1P40692 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH1P40692 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH1P40692 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH1P40692 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH1P40692 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH1P40692 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH1P40692 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH1P40692 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH1P40692 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH1P40692 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH1P40692 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH1P40692 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH1P40692 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH1P40692 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH1P40692 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH1P40692 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH1P40692 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH1P40692 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH1P40692 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH1P40692 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH1P40692 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH1P40692 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH1P40692 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH1P40692 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms